Ergenekon soruşturması kapsamında hazırlanan ikinci iddianamede Anayasa Mahkemesi Başkan Vekili Osman Paksüt'ün eşi Ferda Paksüt'ün de sanıklar arasında olduğu iddia edildi. Paksüt'ün iddianamede yönetici konumunda olan 12 kişiden biri olduğu ileri sürüldü. Osman Paksüt, konuyla ilgili soruları, “Bizim haberimiz yok. Bildirirlerse haberimiz olacak” diye cevaplandırdı. Ergenekon davası kapsamında Ağustos ayında Ankara'da ifade veren Ferda Paksüt'e, Turhan Çömez'le telefon görüşmeleri ve AK Parti'nin kapatılma davasının Anayasa Mahkemesi'nde görüşülmesi sürecindeki gelişmeleri Ergenekon örgütüne aktarmasına ilişkin sorular yöneltildiği öne sürülmüştü.