Cumhurbaşkanı Abdullah Gül''ün talimatıyla kurulan Savunma Reformu Çalışma Grubu''nca hazırlanan ve Cumhuriyet tarihinde ilk defa sivil ve asker uzmanların ortak çalıştığı rapor kamuoyuyla paylaşıldı. Milli Güvenlik Kurulu''nun (MGK) ağustos ayı toplantısında üyelere sunulan 220 sayfalık raporun bir bölümü, Cumhurbaşkanlığının internet sitesinde yayınlandı. Raporda Genelkurmay''ın Milli Savunma Bakanlığı''na (MSB) bağlanmasının sivil-asker işbirliğinin gelişmesine beklenen katkıyı yapmayacağı kaydedildi. Bunun yanında Türk Silahlı Kuvvetleri''nin (TSK) herhangi bir genel müdürlük düzeyinde ele alınamayacağı da vurgulandı.
TSK''nın özel konumunun ABD ya da Fransa''dakine benzer şekilde fiziksel bir mekan kurularak belirlenebileceğine dikkat çekilen raporda, ABD Savunma Bakanlığı ''Pentagon''a benzer bir yapının gerekliliği ifade edildi. Raporda, ''Savunma yönetimi bütünlüğü için MSB, Genelkurmay ve kuvvet komutanlıklarını aynı kampüs içinde toplayacak, ABD veya Fransa''daki benzer bir fiziksel mekan oluşturulsun'' denildi. Raporda şu ifadeler yeraldı: ''Mevcut haliyle bir tedarik ajansı gibi çalışan ve ciddi bir sivil kapasite eksikliği içindeki MSB''ye Genelkurmay gibi güçlü, tecrübeli ve bilgi birikimine sahip bir askeri yapının bağlanması ne arzu edilen düzeyde bir sivil-asker işbirliğini ne daha fazla etkinliği sağlayacaktır. Siyasi otoritenin silahlı kuvvetlerle ilişkisi diğer kamu kuruluşlarıyla olan ilişkilerine, örneğin herhangi bir genel müdürlükle olan ilişkilerine benzeyemez. Demokratik rejimlerde son söz daima siyasi otoritede olmakla birlikte, silahlı kuvvetlerin kendine göre bir hiyerarşisi, disiplin, terfi ve tayin kuralları vardır.''
